Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
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