Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BFSP2Q13515 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms