Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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