Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TCOF1Q13428 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
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