Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SCGB2A2Q13296 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SCGB2A2Q13296 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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SCGB2A2Q13296 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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SCGB2A2Q13296 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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SCGB2A2Q13296 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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SCGB2A2Q13296 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SCGB2A2Q13296 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SCGB2A2Q13296 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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