Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms