Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms