Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms