Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms