Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FMODQ06828 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FMODQ06828 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FMODQ06828 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FMODQ06828 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FMODQ06828 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FMODQ06828 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FMODQ06828 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FMODQ06828 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FMODQ06828 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FMODQ06828 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FMODQ06828 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FMODQ06828 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FMODQ06828 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FMODQ06828 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FMODQ06828 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FMODQ06828 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FMODQ06828 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FMODQ06828 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FMODQ06828 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FMODQ06828 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms