Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms