Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RPS28P62857 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS28P62857 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RPS28P62857 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RPS28P62857 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RPS28P62857 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RPS28P62857 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RPS28P62857 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RPS28P62857 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RPS28P62857 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RPS28P62857 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RPS28P62857 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RPS28P62857 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RPS28P62857 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RPS28P62857 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RPS28P62857 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RPS28P62857 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RPS28P62857 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RPS28P62857 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS28P62857 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms