Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5BP61020 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms