Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ROMO1P60602 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
ROMO1P60602 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms