Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPI1P60174 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPI1P60174 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPI1P60174 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPI1P60174 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPI1P60174 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPI1P60174 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPI1P60174 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPI1P60174 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPI1P60174 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TPI1P60174 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPI1P60174 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPI1P60174 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPI1P60174 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPI1P60174 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPI1P60174 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPI1P60174 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPI1P60174 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPI1P60174 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPI1P60174 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPI1P60174 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPI1P60174 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPI1P60174 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPI1P60174 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPI1P60174 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPI1P60174 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPI1P60174 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPI1P60174 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPI1P60174 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPI1P60174 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPI1P60174 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPI1P60174 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPI1P60174 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPI1P60174 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPI1P60174 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPI1P60174 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPI1P60174 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPI1P60174 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPI1P60174 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPI1P60174 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPI1P60174 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPI1P60174 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPI1P60174 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPI1P60174 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPI1P60174 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPI1P60174 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPI1P60174 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPI1P60174 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPI1P60174 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TPI1P60174 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPI1P60174 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPI1P60174 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPI1P60174 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPI1P60174 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPI1P60174 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPI1P60174 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPI1P60174 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPI1P60174 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPI1P60174 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPI1P60174 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPI1P60174 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPI1P60174 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPI1P60174 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPI1P60174 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPI1P60174 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPI1P60174 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPI1P60174 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPI1P60174 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPI1P60174 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPI1P60174 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPI1P60174 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms