Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX10P56693 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX10P56693 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX10P56693 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX10P56693 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX10P56693 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX10P56693 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX10P56693 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX10P56693 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX10P56693 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX10P56693 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX10P56693 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX10P56693 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX10P56693 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX10P56693 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX10P56693 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX10P56693 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX10P56693 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX10P56693 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX10P56693 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX10P56693 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX10P56693 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX10P56693 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX10P56693 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX10P56693 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX10P56693 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX10P56693 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX10P56693 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX10P56693 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX10P56693 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX10P56693 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX10P56693 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX10P56693 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX10P56693 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX10P56693 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX10P56693 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX10P56693 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX10P56693 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX10P56693 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX10P56693 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX10P56693 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX10P56693 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX10P56693 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX10P56693 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX10P56693 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX10P56693 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX10P56693 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX10P56693 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX10P56693 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX10P56693 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX10P56693 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX10P56693 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX10P56693 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX10P56693 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX10P56693 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX10P56693 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX10P56693 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX10P56693 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX10P56693 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX10P56693 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX10P56693 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX10P56693 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX10P56693 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX10P56693 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX10P56693 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX10P56693 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX10P56693 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX10P56693 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX10P56693 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX10P56693 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX10P56693 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX10P56693 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX10P56693 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX10P56693 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX10P56693 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX10P56693 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX10P56693 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX10P56693 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX10P56693 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX10P56693 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX10P56693 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX10P56693 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX10P56693 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX10P56693 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX10P56693 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX10P56693 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX10P56693 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX10P56693 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX10P56693 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX10P56693 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX10P56693 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX10P56693 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX10P56693 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX10P56693 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX10P56693 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX10P56693 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX10P56693 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX10P56693 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX10P56693 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX10P56693 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms