Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME5P56597 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME5P56597 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME5P56597 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME5P56597 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME5P56597 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME5P56597 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME5P56597 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME5P56597 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME5P56597 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME5P56597 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NME5P56597 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NME5P56597 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NME5P56597 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NME5P56597 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NME5P56597 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NME5P56597 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NME5P56597 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME5P56597 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME5P56597 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME5P56597 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME5P56597 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME5P56597 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME5P56597 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME5P56597 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME5P56597 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME5P56597 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME5P56597 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME5P56597 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NME5P56597 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME5P56597 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME5P56597 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NME5P56597 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME5P56597 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME5P56597 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME5P56597 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME5P56597 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME5P56597 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME5P56597 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME5P56597 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME5P56597 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms