Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms