Protein–RNA interactions for Protein: P51911

CNN1, Calponin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN1P51911 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNN1P51911 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNN1P51911 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNN1P51911 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNN1P51911 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNN1P51911 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN1P51911 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN1P51911 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN1P51911 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN1P51911 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN1P51911 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN1P51911 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN1P51911 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN1P51911 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN1P51911 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN1P51911 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN1P51911 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN1P51911 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN1P51911 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN1P51911 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN1P51911 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN1P51911 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN1P51911 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN1P51911 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN1P51911 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms