Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DAP3P51398 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DAP3P51398 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DAP3P51398 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DAP3P51398 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DAP3P51398 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DAP3P51398 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DAP3P51398 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DAP3P51398 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DAP3P51398 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DAP3P51398 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DAP3P51398 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DAP3P51398 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DAP3P51398 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DAP3P51398 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DAP3P51398 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DAP3P51398 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DAP3P51398 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DAP3P51398 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DAP3P51398 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DAP3P51398 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DAP3P51398 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DAP3P51398 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DAP3P51398 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DAP3P51398 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DAP3P51398 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DAP3P51398 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DAP3P51398 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms