Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NOP2P46087 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NOP2P46087 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NOP2P46087 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NOP2P46087 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NOP2P46087 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NOP2P46087 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NOP2P46087 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NOP2P46087 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NOP2P46087 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NOP2P46087 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NOP2P46087 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOP2P46087 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NOP2P46087 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NOP2P46087 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NOP2P46087 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NOP2P46087 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NOP2P46087 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NOP2P46087 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NOP2P46087 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NOP2P46087 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NOP2P46087 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NOP2P46087 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NOP2P46087 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NOP2P46087 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NOP2P46087 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NOP2P46087 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NOP2P46087 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NOP2P46087 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NOP2P46087 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NOP2P46087 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NOP2P46087 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NOP2P46087 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NOP2P46087 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NOP2P46087 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NOP2P46087 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NOP2P46087 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NOP2P46087 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NOP2P46087 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NOP2P46087 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NOP2P46087 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NOP2P46087 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NOP2P46087 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NOP2P46087 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NOP2P46087 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NOP2P46087 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NOP2P46087 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NOP2P46087 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NOP2P46087 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NOP2P46087 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NOP2P46087 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NOP2P46087 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NOP2P46087 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NOP2P46087 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NOP2P46087 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NOP2P46087 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NOP2P46087 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NOP2P46087 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NOP2P46087 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NOP2P46087 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NOP2P46087 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NOP2P46087 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NOP2P46087 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NOP2P46087 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NOP2P46087 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NOP2P46087 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NOP2P46087 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NOP2P46087 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NOP2P46087 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NOP2P46087 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms