Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNFSF9P41273 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNFSF9P41273 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
TNFSF9P41273 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNFSF9P41273 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNFSF9P41273 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF9P41273 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF9P41273 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF9P41273 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF9P41273 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF9P41273 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF9P41273 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF9P41273 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF9P41273 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF9P41273 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF9P41273 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF9P41273 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF9P41273 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF9P41273 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF9P41273 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF9P41273 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF9P41273 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF9P41273 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF9P41273 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF9P41273 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF9P41273 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF9P41273 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF9P41273 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF9P41273 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF9P41273 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF9P41273 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF9P41273 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF9P41273 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF9P41273 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF9P41273 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF9P41273 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF9P41273 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF9P41273 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF9P41273 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF9P41273 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF9P41273 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF9P41273 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF9P41273 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF9P41273 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF9P41273 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF9P41273 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF9P41273 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF9P41273 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF9P41273 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF9P41273 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF9P41273 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF9P41273 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms