Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms