Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCAP37840 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCAP37840 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCAP37840 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCAP37840 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCAP37840 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCAP37840 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCAP37840 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCAP37840 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCAP37840 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCAP37840 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCAP37840 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCAP37840 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCAP37840 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCAP37840 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCAP37840 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCAP37840 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCAP37840 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCAP37840 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCAP37840 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCAP37840 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCAP37840 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCAP37840 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCAP37840 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCAP37840 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCAP37840 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCAP37840 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCAP37840 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCAP37840 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCAP37840 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCAP37840 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCAP37840 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCAP37840 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCAP37840 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCAP37840 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCAP37840 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCAP37840 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCAP37840 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCAP37840 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCAP37840 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCAP37840 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCAP37840 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCAP37840 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCAP37840 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCAP37840 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCAP37840 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCAP37840 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCAP37840 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCAP37840 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCAP37840 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms