Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZEB1P37275 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZEB1P37275 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZEB1P37275 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZEB1P37275 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZEB1P37275 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZEB1P37275 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZEB1P37275 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ZEB1P37275 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZEB1P37275 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZEB1P37275 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZEB1P37275 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZEB1P37275 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZEB1P37275 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms