Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCVRNP35243 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms