Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJA4P35212 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJA4P35212 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJA4P35212 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJA4P35212 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJA4P35212 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJA4P35212 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJA4P35212 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJA4P35212 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJA4P35212 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJA4P35212 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GJA4P35212 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GJA4P35212 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GJA4P35212 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GJA4P35212 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GJA4P35212 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GJA4P35212 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GJA4P35212 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GJA4P35212 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GJA4P35212 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJA4P35212 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJA4P35212 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GJA4P35212 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GJA4P35212 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GJA4P35212 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GJA4P35212 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJA4P35212 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA4P35212 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA4P35212 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA4P35212 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA4P35212 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA4P35212 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA4P35212 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA4P35212 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA4P35212 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA4P35212 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA4P35212 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA4P35212 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA4P35212 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA4P35212 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA4P35212 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA4P35212 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA4P35212 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA4P35212 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA4P35212 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA4P35212 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA4P35212 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJA4P35212 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA4P35212 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA4P35212 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA4P35212 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA4P35212 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA4P35212 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA4P35212 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA4P35212 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA4P35212 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA4P35212 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA4P35212 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA4P35212 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA4P35212 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA4P35212 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA4P35212 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA4P35212 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA4P35212 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA4P35212 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA4P35212 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA4P35212 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA4P35212 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA4P35212 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA4P35212 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJA4P35212 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJA4P35212 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJA4P35212 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJA4P35212 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms