Protein–RNA interactions for Protein: P28335

HTR2C, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2CP28335 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HTR2CP28335 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HTR2CP28335 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HTR2CP28335 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms