Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms