Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms