Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms