Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms