Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B1P20020 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms