Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms