Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms