Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HKR1P10072 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HKR1P10072 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HKR1P10072 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HKR1P10072 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HKR1P10072 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HKR1P10072 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HKR1P10072 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HKR1P10072 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HKR1P10072 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HKR1P10072 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HKR1P10072 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HKR1P10072 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HKR1P10072 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HKR1P10072 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HKR1P10072 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HKR1P10072 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HKR1P10072 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HKR1P10072 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HKR1P10072 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HKR1P10072 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HKR1P10072 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HKR1P10072 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HKR1P10072 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HKR1P10072 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HKR1P10072 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HKR1P10072 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HKR1P10072 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HKR1P10072 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HKR1P10072 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HKR1P10072 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HKR1P10072 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HKR1P10072 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HKR1P10072 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HKR1P10072 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HKR1P10072 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HKR1P10072 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HKR1P10072 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HKR1P10072 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HKR1P10072 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HKR1P10072 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HKR1P10072 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HKR1P10072 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HKR1P10072 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HKR1P10072 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms