Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00032P0C843 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00032P0C843 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00032P0C843 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00032P0C843 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00032P0C843 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00032P0C843 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00032P0C843 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00032P0C843 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00032P0C843 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00032P0C843 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00032P0C843 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00032P0C843 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00032P0C843 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00032P0C843 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00032P0C843 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00032P0C843 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00032P0C843 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00032P0C843 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00032P0C843 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00032P0C843 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms