Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
C4AP0C0L4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
C4AP0C0L4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C4AP0C0L4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C4AP0C0L4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C4AP0C0L4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C4AP0C0L4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
C4AP0C0L4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C4AP0C0L4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C4AP0C0L4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C4AP0C0L4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C4AP0C0L4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C4AP0C0L4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C4AP0C0L4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C4AP0C0L4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms