Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 MIR583HG-201ENST00000507997 704 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNP04198 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNP04198 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNP04198 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNP04198 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNP04198 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNP04198 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNP04198 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNP04198 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNP04198 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNP04198 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNP04198 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNP04198 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNP04198 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNP04198 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNP04198 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNP04198 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNP04198 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNP04198 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNP04198 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNP04198 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNP04198 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNP04198 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNP04198 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNP04198 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNP04198 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNP04198 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYCNP04198 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYCNP04198 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MYCNP04198 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MYCNP04198 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYCNP04198 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYCNP04198 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MYCNP04198 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MYCNP04198 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MYCNP04198 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYCNP04198 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYCNP04198 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYCNP04198 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYCNP04198 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYCNP04198 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYCNP04198 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYCNP04198 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYCNP04198 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYCNP04198 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYCNP04198 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYCNP04198 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYCNP04198 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYCNP04198 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYCNP04198 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MYCNP04198 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYCNP04198 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYCNP04198 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYCNP04198 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYCNP04198 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYCNP04198 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYCNP04198 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYCNP04198 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYCNP04198 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYCNP04198 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYCNP04198 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYCNP04198 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYCNP04198 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MYCNP04198 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYCNP04198 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYCNP04198 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYCNP04198 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYCNP04198 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MYCNP04198 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYCNP04198 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYCNP04198 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYCNP04198 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYCNP04198 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYCNP04198 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYCNP04198 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms