Protein–RNA interactions for Protein: P02100

HBE1, Hemoglobin subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBE1P02100 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBE1P02100 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBE1P02100 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBE1P02100 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBE1P02100 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBE1P02100 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBE1P02100 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBE1P02100 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBE1P02100 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBE1P02100 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBE1P02100 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBE1P02100 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBE1P02100 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBE1P02100 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBE1P02100 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBE1P02100 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBE1P02100 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBE1P02100 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBE1P02100 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBE1P02100 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBE1P02100 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBE1P02100 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HBE1P02100 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBE1P02100 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBE1P02100 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HBE1P02100 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBE1P02100 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HBE1P02100 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HBE1P02100 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HBE1P02100 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HBE1P02100 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HBE1P02100 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HBE1P02100 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HBE1P02100 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HBE1P02100 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HBE1P02100 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HBE1P02100 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HBE1P02100 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HBE1P02100 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HBE1P02100 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HBE1P02100 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HBE1P02100 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HBE1P02100 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBE1P02100 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBE1P02100 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBE1P02100 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBE1P02100 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBE1P02100 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBE1P02100 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBE1P02100 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBE1P02100 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBE1P02100 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HBE1P02100 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBE1P02100 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HBE1P02100 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBE1P02100 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBE1P02100 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBE1P02100 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBE1P02100 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBE1P02100 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBE1P02100 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBE1P02100 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBE1P02100 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBE1P02100 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBE1P02100 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBE1P02100 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBE1P02100 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBE1P02100 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBE1P02100 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBE1P02100 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms