Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms