Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYF2O95926 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYF2O95926 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYF2O95926 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYF2O95926 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYF2O95926 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYF2O95926 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYF2O95926 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYF2O95926 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYF2O95926 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYF2O95926 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYF2O95926 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SYF2O95926 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYF2O95926 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYF2O95926 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYF2O95926 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYF2O95926 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SYF2O95926 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYF2O95926 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYF2O95926 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYF2O95926 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYF2O95926 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYF2O95926 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYF2O95926 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYF2O95926 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYF2O95926 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYF2O95926 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYF2O95926 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYF2O95926 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYF2O95926 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYF2O95926 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYF2O95926 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYF2O95926 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYF2O95926 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYF2O95926 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYF2O95926 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SYF2O95926 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYF2O95926 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYF2O95926 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYF2O95926 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYF2O95926 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYF2O95926 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SYF2O95926 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYF2O95926 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYF2O95926 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYF2O95926 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYF2O95926 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYF2O95926 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYF2O95926 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYF2O95926 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYF2O95926 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYF2O95926 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYF2O95926 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYF2O95926 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYF2O95926 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYF2O95926 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SYF2O95926 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYF2O95926 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYF2O95926 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYF2O95926 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYF2O95926 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYF2O95926 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYF2O95926 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYF2O95926 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYF2O95926 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYF2O95926 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYF2O95926 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYF2O95926 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYF2O95926 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYF2O95926 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYF2O95926 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYF2O95926 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYF2O95926 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYF2O95926 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYF2O95926 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYF2O95926 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYF2O95926 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYF2O95926 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYF2O95926 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYF2O95926 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYF2O95926 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYF2O95926 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYF2O95926 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYF2O95926 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYF2O95926 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYF2O95926 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYF2O95926 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYF2O95926 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYF2O95926 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYF2O95926 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYF2O95926 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYF2O95926 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYF2O95926 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYF2O95926 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYF2O95926 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYF2O95926 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYF2O95926 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYF2O95926 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYF2O95926 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYF2O95926 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms