Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX58O95786 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX58O95786 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX58O95786 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX58O95786 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX58O95786 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX58O95786 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX58O95786 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX58O95786 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX58O95786 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX58O95786 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX58O95786 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX58O95786 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX58O95786 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX58O95786 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX58O95786 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX58O95786 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX58O95786 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX58O95786 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX58O95786 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX58O95786 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX58O95786 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX58O95786 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX58O95786 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX58O95786 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX58O95786 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX58O95786 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX58O95786 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX58O95786 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX58O95786 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX58O95786 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX58O95786 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX58O95786 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX58O95786 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX58O95786 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX58O95786 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX58O95786 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX58O95786 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX58O95786 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX58O95786 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX58O95786 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX58O95786 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX58O95786 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX58O95786 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX58O95786 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX58O95786 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX58O95786 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX58O95786 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX58O95786 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX58O95786 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX58O95786 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX58O95786 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX58O95786 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX58O95786 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX58O95786 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX58O95786 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX58O95786 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX58O95786 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX58O95786 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX58O95786 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX58O95786 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX58O95786 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX58O95786 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX58O95786 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX58O95786 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX58O95786 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX58O95786 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX58O95786 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX58O95786 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX58O95786 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX58O95786 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX58O95786 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX58O95786 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX58O95786 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX58O95786 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX58O95786 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX58O95786 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX58O95786 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX58O95786 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX58O95786 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX58O95786 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX58O95786 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX58O95786 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX58O95786 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX58O95786 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX58O95786 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX58O95786 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX58O95786 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX58O95786 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX58O95786 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX58O95786 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX58O95786 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX58O95786 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX58O95786 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX58O95786 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX58O95786 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX58O95786 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DDX58O95786 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DDX58O95786 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DDX58O95786 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms