Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD1O95696 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD1O95696 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD1O95696 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD1O95696 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD1O95696 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD1O95696 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD1O95696 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD1O95696 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD1O95696 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD1O95696 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD1O95696 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD1O95696 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD1O95696 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD1O95696 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD1O95696 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD1O95696 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD1O95696 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD1O95696 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD1O95696 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD1O95696 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD1O95696 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD1O95696 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD1O95696 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD1O95696 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD1O95696 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD1O95696 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD1O95696 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD1O95696 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD1O95696 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD1O95696 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD1O95696 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD1O95696 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD1O95696 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD1O95696 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD1O95696 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD1O95696 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD1O95696 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD1O95696 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD1O95696 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD1O95696 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD1O95696 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD1O95696 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD1O95696 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD1O95696 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD1O95696 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD1O95696 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD1O95696 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD1O95696 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRD1O95696 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRD1O95696 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRD1O95696 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRD1O95696 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRD1O95696 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRD1O95696 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRD1O95696 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRD1O95696 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRD1O95696 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRD1O95696 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BRD1O95696 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRD1O95696 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRD1O95696 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRD1O95696 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRD1O95696 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRD1O95696 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRD1O95696 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD1O95696 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD1O95696 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD1O95696 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD1O95696 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms