Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms