Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms