Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F3O00716 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F3O00716 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F3O00716 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F3O00716 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F3O00716 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F3O00716 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F3O00716 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F3O00716 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F3O00716 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F3O00716 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F3O00716 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F3O00716 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F3O00716 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F3O00716 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F3O00716 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F3O00716 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F3O00716 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F3O00716 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F3O00716 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F3O00716 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F3O00716 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F3O00716 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F3O00716 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F3O00716 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F3O00716 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F3O00716 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F3O00716 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F3O00716 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F3O00716 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F3O00716 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F3O00716 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F3O00716 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F3O00716 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F3O00716 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F3O00716 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F3O00716 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F3O00716 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F3O00716 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F3O00716 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F3O00716 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F3O00716 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F3O00716 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F3O00716 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F3O00716 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F3O00716 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F3O00716 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F3O00716 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F3O00716 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F3O00716 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F3O00716 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F3O00716 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F3O00716 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F3O00716 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F3O00716 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F3O00716 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F3O00716 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F3O00716 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F3O00716 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F3O00716 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F3O00716 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F3O00716 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
E2F3O00716 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
E2F3O00716 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F3O00716 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms