Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms