Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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