Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms